伊勢神宮が日本の昼を守る神社であり、日御碕神社は夜を守る神社です。日沈の宮という名前は伊勢神宮が日本の昼を守るというのに対し、日御碕神社は日本の夜を守るようにと勅命を受けたことに由来します。神社は下の宮「日沈宮（ひしずみのみや）」と上の宮「神の宮 」という上下二社からなり、両本社を総称して『日御碕神社』と呼びます。 日沈の宮にはアマテラスオオミカミが、神の宮にはスサノヲノミコトが祭られています。